Protein–RNA interactions for Protein: J3QMW9

Btbd35f6, BTB domain-containing 35, family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f6J3QMW9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Btbd35f6J3QMW9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd35f6J3QMW9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms