Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
1700014D04RikJ3QMS2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms