Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AK157302I3ITR1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AK157302I3ITR1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms