Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20517G3UVU6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm20517G3UVU6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms