Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
BicraF8VPZ9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
BicraF8VPZ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
BicraF8VPZ9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
BicraF8VPZ9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
BicraF8VPZ9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms