Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.26
Ercc6F8VPZ5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ercc6F8VPZ5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ercc6F8VPZ5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Ercc6F8VPZ5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ercc6F8VPZ5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms