Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28048F7BCN0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28048F7BCN0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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