Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dcdc2bF7BCK0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dcdc2bF7BCK0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dcdc2bF7BCK0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms