Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Urb2E9Q7L1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Urb2E9Q7L1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Urb2E9Q7L1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms