Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc85cE9Q6B2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc85cE9Q6B2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc85cE9Q6B2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms