Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Pdzd2E9Q1M1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Pdzd2E9Q1M1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Pdzd2E9Q1M1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Pdzd2E9Q1M1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Pdzd2E9Q1M1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Pdzd2E9Q1M1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Pdzd2E9Q1M1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdzd2E9Q1M1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Pdzd2E9Q1M1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdzd2E9Q1M1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Pdzd2E9Q1M1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Pdzd2E9Q1M1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Pdzd2E9Q1M1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Pdzd2E9Q1M1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd2E9Q1M1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Pdzd2E9Q1M1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd2E9Q1M1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Pdzd2E9Q1M1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd2E9Q1M1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd2E9Q1M1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd2E9Q1M1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd2E9Q1M1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd2E9Q1M1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd2E9Q1M1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd2E9Q1M1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms