Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Atad2bE9Q166 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Atad2bE9Q166 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Atad2bE9Q166 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Atad2bE9Q166 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Atad2bE9Q166 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Atad2bE9Q166 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Atad2bE9Q166 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Atad2bE9Q166 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Atad2bE9Q166 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Atad2bE9Q166 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Atad2bE9Q166 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Atad2bE9Q166 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Atad2bE9Q166 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Atad2bE9Q166 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms