Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
4930407I10RikD3Z5T8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
4930407I10RikD3Z5T8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
4930407I10RikD3Z5T8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
4930407I10RikD3Z5T8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms