Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm5934D3Z4U6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm5934D3Z4U6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm5934D3Z4U6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 241.3 ms