Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptprz1B9EKR1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptprz1B9EKR1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms