Protein–RNA interactions for Protein: B5X0E4

Abcb5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb5B5X0E4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb5B5X0E4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb5B5X0E4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb5B5X0E4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb5B5X0E4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb5B5X0E4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb5B5X0E4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb5B5X0E4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb5B5X0E4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcb5B5X0E4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb5B5X0E4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb5B5X0E4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb5B5X0E4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb5B5X0E4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb5B5X0E4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb5B5X0E4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcb5B5X0E4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcb5B5X0E4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb5B5X0E4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcb5B5X0E4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcb5B5X0E4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcb5B5X0E4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Abcb5B5X0E4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcb5B5X0E4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcb5B5X0E4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb5B5X0E4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb5B5X0E4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb5B5X0E4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb5B5X0E4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb5B5X0E4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb5B5X0E4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb5B5X0E4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms