Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700018F24RikB2RW27 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700018F24RikB2RW27 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms