Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm2012B1B0R1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm2012B1B0R1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm2012B1B0R1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms