Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik3B1AS29 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Grik3B1AS29 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grik3B1AS29 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms