Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PtprsB0V2N1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PtprsB0V2N1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms