Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttll11A4Q9F4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms