Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Frmpd1A2AKB4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Frmpd1A2AKB4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Frmpd1A2AKB4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Frmpd1A2AKB4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Frmpd1A2AKB4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms