Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm12A2AJ77 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prdm12A2AJ77 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prdm12A2AJ77 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms