Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prdm11A2AGX3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prdm11A2AGX3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prdm11A2AGX3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms