Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
1700023F06RikA2AB62 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700023F06RikA2AB62 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700023F06RikA2AB62 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms