Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hivep3A2A884 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hivep3A2A884 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms