Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf19bA2A7Q9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf19bA2A7Q9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf19bA2A7Q9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms