Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Phc2Q9QWH1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Phc2Q9QWH1 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms