Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp12Q9D9M2 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Usp12Q9D9M2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms