Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Use1Q9CQ56 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Use1Q9CQ56 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Use1Q9CQ56 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Use1Q9CQ56 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Use1Q9CQ56 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Use1Q9CQ56 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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