Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg3Q9CPX6 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms