Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp16Q99LG0 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp16Q99LG0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms