Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rab28Q99KL7 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Rab28Q99KL7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Rab28Q99KL7 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Rab28Q99KL7 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rab28Q99KL7 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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