Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Emc3Q99KI3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms