Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf144aQ925F3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf144aQ925F3 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rnf144aQ925F3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rnf144aQ925F3 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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