Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms