Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rdh13Q8CEE7 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms