Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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ChfrQ810L3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
ChfrQ810L3 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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