Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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Xrcc1Q60596 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Xrcc1Q60596 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Xrcc1Q60596 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Xrcc1Q60596 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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Xrcc1Q60596 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Xrcc1Q60596 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Xrcc1Q60596 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Xrcc1Q60596 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Xrcc1Q60596 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Xrcc1Q60596 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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Xrcc1Q60596 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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