Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp48Q3V0C5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp48Q3V0C5 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Usp48Q3V0C5 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp48Q3V0C5 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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