Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm5aQ3UXZ9 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm5aQ3UXZ9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm5aQ3UXZ9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm5aQ3UXZ9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm5aQ3UXZ9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms