Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43255-201ENSMUST00000198885 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33263-201ENSMUST00000220371 459 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12202-201ENSMUST00000121196 811 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43903-201ENSMUST00000205126 617 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms