Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Q3U6N9 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Q3U6N9 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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