Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms