Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms