Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Top2aQ01320 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Top2aQ01320 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms