Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
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Mesp1P97309 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Mesp1P97309 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Mesp1P97309 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Mesp1P97309 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Mesp1P97309 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Mesp1P97309 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Mesp1P97309 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Mesp1P97309 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Mesp1P97309 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Mesp1P97309 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Mesp1P97309 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Mesp1P97309 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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