Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pkn1P70268 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms