Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Itga11P61622 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms