Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Irf5P56477 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf5P56477 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Irf5P56477 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Irf5P56477 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf5P56477 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Irf5P56477 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Irf5P56477 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Irf5P56477 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Irf5P56477 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Irf5P56477 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Fxr1-202ENSMUST00000167354 1986 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irf5P56477 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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